16世纪时，基督教改革席卷整个欧洲。改革的两位重要领导人乌尔里希·慈运理（Ulrich Zwingli）和约翰·加尔文（Jean Calvin）都是瑞士人。从总体上看，瑞士较富裕的乡村和工业化城市接受了新教。日内瓦成为基督教的最坚决拥护者，并为受天主教压迫的流亡者，如加尔文，提供避难港。这些流亡者为日内瓦的知识和经济生活做出了巨大贡献。基督教徒重视合理性与辛勤工作，认为健康是上帝的恩赐：这种意识形态为现代瑞士的繁荣奠定了基础。

1848的瑞士宪法确立了今天的联邦政体。当时的宪法是由一名激进派的基督教徒起草的。他认为较高的中央集权是工业化经济发展必不可缺的。联邦政府创建了统一的货币制度，取消了各州不同的货币形式，从而解除了国内贸易的障碍。