与欧洲其它国家一样，宗教革新使得瑞士联盟投入战争：一些地区信仰旧的教义，忠诚于罗马主教，而另一些地区支持革新派。

苏黎世官方于1525年采取革新，是当时瑞士第一个进行革新的州。兹温格利的传教对城市中具经济优势的居民很有吸引力。除了索罗图恩和弗里堡外，大多数城市改信新教。

然而在瑞士中部乡村，缺乏教育的村民并不欢迎兹温格利的教义。这里不仅存在着宗教原因，而且势力过大的苏黎世也不能取得村民的信任。

各州都发现没有妥协的可能。革新的各州相互联合；而信奉天主教的地区打破联盟宣誓，与奥地利的费迪南德(Ferdinand)伯爵取得联合。

兹温格利希望将新教义传遍整个联盟，而天主教州拒绝信奉他的教义；由此引发了兹温格利和天主教派的战争。他的第一次尝试在1529年遭到挫败；1531年，在卡迫尔(Kappel)的第二次战争中，天主教高等部队粉碎了苏黎世军，兹温格利被杀害。

之后，迫于威胁，革新地区联盟纷纷解体。但是，革新州与天主教州最终同意尊重对方的宗教选择。