十八世纪四十年代，进步派和保守派进一步分裂。他们的分歧主要表现在天主教会，特别是基督会信徒的角色和势力。

1844年，卢塞恩邀请基督教会信徒管理中学教育。这一举动惊骇了全国各地的进步派人士。尽管该措施完全符合瑞士宪法的规定，但激进派仍认为是教皇指使，有些人甚至试图推翻卢塞恩政府。

为保护各自的权益，七个保守州：施维茨、乌里、下瓦尔登、卢塞恩、楚格、弗里堡和瓦莱州秘密地结成了所谓的“独立联盟(Sonderbund)”。其目的在于保护他们的权力和利益。这七个州还向外国势力请求援助。1845年，当这一消息公布于众的时候，自由派要求立即解散“独立联盟”。直到1847年，才有足够的自由政府州投票通过这一决议：国会宣布“独立联盟”违反了联邦条约。