法国废除了当时所有的政府和宪法，彻底重建政治机构。

多数从属国的人们对旧政权的瓦解感到欣慰，很多人都希望取而代之可以建立一个松散的联邦：一个权力较平均分配的联邦，各地享受同等的权力。

但现实总是与理想存在差异。瑞士革命者在法国的支持下，为中央化的海尔维第共和国拟定了宪法，并于1798年被采用。

州与州之间的划分，隶属制度和共同统治被废除；行政管理被重新划分，与历史完全不同。一个松散的联邦议会被两院国会代替，国会成员通过间接选举选出，并由五位领导人组成政府。

尽管政府是由瑞士人管理的，但法国却迫使瑞士采取了很多不得人心的措施。其中包括为法国部队提供住所饮食，这对老百姓来说花费很大；此外，还允许法国军队把瑞士作为穿越路线经。

瑞士同时被迫接受了与法国结盟的协议，破坏了其中立的传统。