1798到1815年间，瑞士的版图多次发生改变，有时是由于政治法案，有时是由于战争的缘故。

1798年，日内瓦和幕豪斯(Mulhouse)的联盟地区与法国合并。1802年，瓦莱州从海尔维第共和国脱离出来，独立数年。直到1810年，拿破仑将瓦莱州作为辛普隆(Simplon)省并入法国。瓦莱州和瑞士脱离后，法国控制了两条重要的通道：辛普隆通道和大圣伯纳德通道，不再需要通过瑞士领土。

同时，瑞士也获得了部分领土：位于巴塞尔东部的莱茵河上，前奥地利弗理克塔尔(Fricktal)的领地。1799年，该地区被法国侵略；1802年成为海尔维第共和国领土的一部分。这一划分虽然持续时间短暂，但调停法案后，它成为阿尔高州的一部分，直至今天。

1799到1800年间，格劳宾登曾先后易手于法国和奥地利两国之间，但法国取得了最终的胜利。1801年，拿破仑宣布格劳宾登成为瑞士的第16个州。但是，格劳宾登州最终还是失去了其从属领地，拿破仑于1797年将这些地区并入Cisalpine共和国；至今仍属于现代意大利。