生物燃料是由有机物生产而来的。它们不会产生比原生物更多的二氧化碳。

生物燃料包括下面几种：

生物汽油

生物汽油被用在汽油车上，是由植物和木料垃圾发酵制造的。生物汽油中含有约三分之二的甲烷和三分之一的二氧化碳。污水是生物汽油的另一来源，并首先在伯尔尼的公共交通中试用。目前大多数的生物汽油站位于苏黎世地区。如果瑞士产生的上百万吨的有机废物都能被转换成生物汽油，每年将能提供100000辆汽车行驶10000公里所需的能源。生物汽油不仅被用作汽车燃料，而且还被用来取暖和电力。

生物柴油

生物柴油可以使用植物油通过化学程序生产，通常使用油菜。通常用来炒菜的食用油可以变成柴油。生物柴油产生的细微粒比一般柴油少，而且机会不产生硫磺。生物柴油可以单独使用，也可以跟其他柴油混合使用。

生物柴油的支持者表示：在一般柴油中加入5%的生物柴油，就可以减少瑞士830,000多吨的二氧化碳排放量。这样，就实现了京都倡议中的目标的20%。通过这一途径，瑞士还将增加新的就业机会，特别是在农业和林业部门，并降低瑞士对国外燃料供给的依赖。

但是，目前生物柴油的实际生产需要消耗很多能源。