瑞士的主机场位于苏黎世附近的克洛滕(Kloten)。日内瓦和巴塞尔也建有大规模的机场。日内瓦机场部分建在法国境内；而巴塞尔机场只有南面登机口位于瑞士境内，其余部分均位于法国境内，有一部分位于德国的弗莱堡市。伯尔尼和卢加诺的机场较小，航线只飞往欧洲国家。此外，瑞士还有很多小型民用机场。圣莫里茨附近萨梅丹(Samedan)机场是欧洲最高的机场，海拔1707米。

克洛滕机场现由私人公司Unique经营，2000年开始进行扩大项目，以巩固加强起欧洲位置。但由于2001年10月瑞士航空公司倒闭，美国911事件后客源锐减，该策略受到了严重影响。

克洛滕机场所经营的航线占瑞士的三分之一。

与其它欧洲各大城市一样，瑞士慢慢才接受了喷气式飞机。今天，注册的喷气式飞机越来越多。只有一些顶级公司有自己的飞机；而大多公司使用出租飞机公司的服务。到2002年，瑞士大约注册了约100架商业飞机，相当于每七万瑞士人一架。德国和法国分别是每40万人和每50万人一架。日内瓦是欧洲唯一举行每年一度飞机展的地方。