連邦議会は、国民議会と全州議会の二院からなり、両院には同等の権限が与えられている。国民を代表する国民議会（下院）は、各州から州の人口に応じて比例代表制で選出された200名の議員で構成されており、全州議会（上院）は、小さな州の国政に対する比較的大きな影響力を保証するために、州から選出された2名と準州から選出された1名の46名で構成されている。連邦議員の総選挙は4年ごとに行われる。

両院は憲法や法律の改正について協議し、連邦行政を監督する。両院は年に1回合同会議を開き、連邦議会の代表者である大統領や副大統領の選出を行う。

国民議会と全州議会の議長は1年交代で選出され、毎年違う議員が議長役を務める。国民が最高の主権者であるスイスにおいて国民議会議長は、実質的な国民の代表者のトップである。