Il terzo gruppo religioso più numeroso in Svizzera è l'Islam. Il censimento del 2000 ha mostrato oltre 300'000 abitanti di religione musulmana nel paese, un numero più che raddoppiato rispetto al 1990. Molti tra questi sono rifugiati o richiedenti l'asilo, ma anche il numero di cittadini svizzeri di religione musulmana è aumentato da 7'700 a 36'500 in dieci anni.

Il numero di cristiani ortodossi è a sua volta aumentato in seguito alla forte immigrazione dall'Europa centrale ed orientale, con un totale che supera i 130'000 fedeli.

La comunità ebraica è rimasta costante con circa 17'900 fedeli.

Sono inoltre presenti 20'000 buddisti suddivisi tra le varie scuole; poco più della metà sono cittadini svizzeri. Nel 2003 a Soletta è stato aperto il più grande tempio buddista della Svizzera, il Srinagarindravararam, seguace della scuola Theravada.

Il numero di persone che dichiara di non appartenere a nessuna religione è in costante aumento: secondo i dati più recenti superava l'11% della popolazione, contro il 7,4% del 1990 e l'1,1% del 1970.