La Suisse à abrité deux des personnages clés de la Réforme protestante qui a balayé l'Europe au XVIème siècle: Ulrich Zwingli et Jean Calvin.

A l'échelle du pays ce sont les cantons ruraux les plus riches et les villes où se sont ensuite développés des centres industriels qui ont adopté la nouvelle religion. Genève en particulier est devenue une des places fortes du Protestantisme et un havre pour les réfugiés, dont Calvin, fuyant l'oppression des pays catholiques. Ces réfugiés ont ensuite largement contribué à la vie économique et intellectuelle du pays. Les Protestants valorisent rationalisme, et dur labeur, et considèrent l'aisance financière comme une récompense de Dieu, éthique qui a permis de poser les fondations de la prospérité suisse moderne.

La constitution de 1848 créant l'Etat Suisse Fédéral tel que nous le connaissons aujourd'hui a été conçue par des radicaux protestants qui pensaient qu'une plus grande centralisation était essentielle au développement de l'économie industrialisée.