Les Grisons, qui n’étaient pas encore un membre à part entière du Corps Helvétique mais un allié des cantons, paient un lourd tribut à la guerre. D’une part, à cause de leur situation géographique et, d’autre part, à cause de leur structure administrative et religieuse.

Toutes les parties au conflit convoitent les cols alpins des Grisons en raison de leur importance stratégique. En effet, ils constituent l’unique point de passage entre l’Autriche et les possessions espagnoles du Nord de l’Italie qui appartiennent tous deux aux Habsbourg. Le contrôle des cols est donc décisif car la mobilité des troupes impériales entre les fronts en dépend.

À cette époque, les Grisons sont une fédération composée de trois entités, les Ligues grisonnes, que leurs liens plutôt lâches rendent vulnérables.

En outre, elles sont partagées par une frontière religieuse. La Valteline en particulier, sujet des Ligues à majorité catholique situé au Sud des Alpes, ne supporte plus la domination protestante. C’est dans ce contexte qu’en 1620 se déroule l’épisode dit du « Sacro Macello » (littéralement la sainte boucherie) au cours duquel les catholiques de la Valteline, aidés des troupes espagnoles stationnées à Milan, massacrent de nombreux protestants.

À la suite de cet événement les grandes puissances décident d’intervenir et la région change de mains à plusieurs reprises. Le pasteur Jörg Jenatsch (1596-1639) se bat pour l’indépendance en s’alliant tout d’abord aux Français dont les troupes, conduites par le Duc de Rohan, boutent les Autrichiens hors de la Valteline. Mais lorsqu’il découvre que la France a l’intention de garder la mainmise sur ce territoire,Jenatsch se convertit au catholicisme et s’allie aux Habsbourg. Il sera assassiné en 1639 en ayant toutefois atteint son but : garder la Valteline dans le giron des Ligues grisonnes.