L'échec de la campagne de Russie en 1812 marque le début de la fin de l'hégémonie napoléonienne en Europe et les alliés – sous l'impulsion de l'Autriche – font tout pour saper l'influence française en Suisse.

Les autorités en place avant la Révolution sont réinstallées et fin 1813, les anciennes constitutions cantonales – avec tout ce qu'elles impliquent d'inégalités politiques et sociales – remises en vigueur.

Les nouveaux cantons ne sont cependant pas abolis malgré l'opposition de leurs anciens dirigeants qui souhaitent leur restauration.

En vertu d'un nouveau Pacte fédéral, signé en août 1815, les cantons regagnent leur souveraineté dans tous les domaines à l'exception de la politique étrangère.

Le Valais, Neuchâtel et Genève adhèrent à la Confédération en 1815. Quant au territoire de l'ancien Evêché de Bâle – région du Jura – , il est rattaché pour l'essentiel au canton de Berne. Ce sera jusqu'à nos jours la dernière modification de frontière de la Suisse.