Il y a dix universités en Suisse: trois sont francophones (Genève, Lausanne et Neuchâtel); cinq germanophones (Bâle, Berne, Zurich, Lucerne et St-Gall); une italophone (Lugano). L'université de Fribourg a la particularité presque unique en Europe d'être bilingue (français-allemand).

Les universités sont gérées par les cantons, qui assument également une large part de leur financement.

En plus des universités cantonales, il faut mentionner les deux Ecoles polytechniques fédérales (EPF) de Zurich et Lausanne, qui relèvent de la compétence unique de la Confédération.

Les hautes écoles spécialisées (HES) dispensent un enseignement de niveau universitaire axé sur la pratique dans les domaines de la technique, de l'administration, de l'agronomie, des arts appliqués, de la santé, du social et de l'éducation.

Les HES sont organisées en réseau depuis 1993 et relèvent de la compétence de la Confédération. Elles sont au nombre de sept et regroupent plus de 60 établissements d'enseignement, parmi lesquels 15 hautes écoles pédagogiques (HEP), responsables de la formation des enseignants.