La Suisse figure parmi les plus grands producteurs de produits pharmaceutiques. L'industrie chimique, qui s'est spécialisée dans les colorants, les essences de parfum et les arômes alimentaires, a fait de Bâle sa métropole. Les principales entreprises pharmaceutiques suisses sont Hoffmann-La Roche et Novartis (cette dernière est née de la fusion de Ciba-Geigy et de Sandoz en 1996).

Tout comme l'industrie des machines, l'industrie chimique a pu démarrer en Suisse grâce à l'industrie textile qui était une grande consommatrice de colorants artificiels. Jusqu'à la fin du XIXème siècle, l'industrie chimique suisse se consacrait presque exclusivement à la production de colorants. Aujourd'hui, c'est la production pharmaceutique qui a pris la première place.