La tercera religión más grande en Suiza es el Islam. El censo del año 2000 reveló que la comunidad islámica en Suiza asciende a un número de 300.000 musulmanes, casi dos veces más que en 1990. Muchos entre ellos son refugiados o asilados, pero hay también muchos con nacionalidad suiza, cuyo número ha subido de 7.700 en 1990 a 36.500 diez años más tarde.

El número de cristianos ortodoxos también ha crecido a consecuenca de la inmigración de personas procedentes de países de la Europa del este. Su número asciende a un total de 130.000 creyentes.

La comunidad hebrea no sufrió casi ningún cambio, integrándose hoy por hoy de cerca de 17.900 judíos.

Hay, además, una pequeña comunidad budista constituida de 21.000 fieles de distintas escuelas. Casi la mitad entre ellos son naturales. El templo budista más grande del país, el llamado Wat Srinagarindravararam, abrió sus puertas en el 2003 en el Cantón de Soleura. Estos budistas son seguidores de la escuela Theravada.

Hubo en la última década un incremento considerable en el número de gente atea, o mejor dicho, de gente que no pertenece a ninguna comunidad religiosa. En la actualidad constituye con un 11 por ciento de la población una fracción importante.