La gran mayoría del agua corriente en Suiza ya no fluye por cauces naturales. Casi un cuarto de todos los ríos suizos fluye por cauces artificiales o cuencas que están cubiertas u obstruidas.

También muchos lagos poseen diques artificiales para proteger sus orillas de la erosión, a pesar de que impiden al mismo tiempo que el mecanismo de autodepuración de los lagos funcione debidamente.

A causa de las repetidas crecidas históricas de algunos ríos en el siglo XIX se empezaron a canalizar y enderezar sus cursos.

Los ejemplos más conocidos son el encauzamiento del río Linth entre el Lago de Walen y el Lago de Zúrich y la regulación de los cursos de agua del Jurá en la región de los lagos de Biena, Murten y Neucastel. Estas correcciones resolvieron un problema crónico de la población que vivía en esas zonas y crearon a la vez vastas extensiones de tierra cultivable.

A partir de entonces se han canalizado y encauzado muchos ríos en Suiza. Sin embargo, esto provocó un decrecimiento de los hábitats naturales y supuso una pérdida de la biodiversidad. Además trasplantó el problema de las inundaciones a regiones que se encontraban en la parte inferior de los cursos fluviales dado que se habían reducido drásticamente las llanuras de inundación natural en el curso superior de los ríos encauzados.

Por eso, hoy en día, muchos ríos se vuelven a restaurar en su estado natural.