Biofuels (Biotreibstoffe) sind Treibstoffe pflanzlicher Herkunft; sie werden aus organischem Material (Biomasse) hergestellt. Bei der Verbrennung von Biofuels wird nicht mehr CO2 freigesetzt, als während des Wachstums der Pflanzen in der Biomasse gebunden wurde. Biotreibstoffe haben somit den Vorteil, dass sie CO2-neutral sind. In einer umfassenden Energiebilanz muss allerdinsg berücksichtigt werden, dass es auch beim Anbau und der Produktion von Biotreibstoffen zu CO2-Emissionen kommt.

Folgende Typen von Biotreibstoffen werden unterschieden:

Biogas

Biogas entsteht durch Vergärung von organischem Material wie Grünabfällen, Holz, Mist oder Klärschlamm in speziellen Biogas-Anlagen. Es besteht vorwiegend aus Methan (CH4) sowie einem Drittel Kohlendioxid und wird für den Betrieb von Gasfahrzeugen eingesetzt. Es kann aber auch zur Produktion von Strom und Wärme in den Haushalten dienen.

Die Nutzung von Methangas aus Klärschlamm wurde im Rahmen eines Pilots der Verkehrsbetriebe der Stadt Bern 2005 eingesetzt; die Linienbusse wurden schrittweise von Diesel auf Biogas umgerüstet.

Die dichteste Biogas-Tankstellennetzt findet sich im Grossraum Zürich.

Bioethanol

Bioethanol wird aus zucker-, stärke- sowie zellulosehaltige Pflanzen gewonnen; durch die Umwandlung von Zuckern entsteht Ethylalkohol, welcher mit konventionellem Benzin gemischt werden kann. Schweizer Bioethanol stammt vorwiegend aus Abfällen der Holzindustrie (Zellulose-Ethanol). In Brasilien und in den USA wird am meisten produziert; in Brasilien ist die Nutzung sogar sehr populär. In Europa weist Schweden mit einem dichten Netz an Bioethanol-Tankstellen die höchste Nutzung auf.

Im Kanton Solothurn wurde 2005 eine Pilot-Produktionsanlage in Betrieb genommen, welche Ethanol aus Zellulose-Abfällen herstellt. Weitere Produktionsstätten und Anwendungen wie die Verwertung von landwirtschaftlichen Abfällen sind geplant. Die Schweiz kann bis zu 50% ihres Eigenbedarfs decken; der Rest muss importiert werden.

bEnzin5, in der Westschweiz unter dem Namen essEnce5 gebräuchlich, besteht zu aus 5% aus Bioethanol und zu 95% aus Benzin. Bei diesem Mischverhältnis sind weder technische Anpassungen an den Autos noch an den Tankstelleneinrichtungen nötig. bEnzin5 kostet gleichviel wie herkömmliches Benzin, da das Ethanol im Rahmen eines Pilotprojekts der Alcosuisse von der Verbrauchssteuer auf Mineralölen befreit ist.

E85 besteht zu 85% aus Bioethanol und zu 15% aus herkömmlichem Benzin. Die erste Schweizer E85-Tankstelle wurde im Juli 2006 eröffnet. Für den Einsatz von E85 müssen sowohl am Auto wie auch an den Tankstelleneinrichtungen technische Anpassungen vorgenommen werden.

In Schweden, den USA und Brasilien sind sogenannte Flexible Fuel Vehicles, kurz FFV, auf dem Markt, welche sowohl mit herkömmlichem Benzin als auch mit E85 betrieben werden können. Die ersten Schweizer FFV wurden 2006 lanciert.

bEnzin5 (mit 5% Bioethanol) verursacht 3,5% weniger CO2-Emissionen als herkömmliches Benzin. Bei der Verwendung von E85 wird sogar eine CO2-Reduktion von 75% erzielt. Die Befürworter von Biotreibstoffen schätzen, dass bereits das 5prozentige bEnzin5 den CO2-Ausstoss der Schweiz um mehr als 830'000 Tonnen pro Jahr reduzieren würde – dies bedeutet nahezu 20% der im Rahmen des Kyoto-Protokolls geforderten Reduktionsmenge. Ausserdem weisen sie darauf hin, dass Bioethanol eine unabhängige Energieversorgung sowie eine Verringerung der Abhängigkeit vom Erdöl zur Folge habe. Für die Schweizer Landwirtschaft ergäben sich zudem neue Produktionsmöglichkeiten und damit die Sicherung von Arbeitsplätzen in strukturarmen Regionen.

Biodiesel

Biodiesel oder Pflanzenöl-Methyl-Esther PME wird aus Pflanzenölen, insbesondere Rapsöl, hergestellt. Auch gebrauchtes Fritieröl kann zu Biodiesel verarbeitet werden. Biodiesel überzeugt mit tieferen Abgaswerten sowie deutlich geringerem Feinpartikelausstoss. Ausserdem wird kein Schwefel abgegeben. Biodiesel kann ausschliesslich oder als Zusatz zum konventionellen Diesel eingesetzt werden.